大学毕业后，朴赞郁加入了刘英振导演的电影《Ggam－dong》剧组，既做助理导演，也做制片。 1990年，透过研讨会的前辈介绍到李长镐导演旗下的公司任副导，以助理导演身份参与拍摄了郭在容导演的《雨天的水彩画》。 1992年，朴赞郁的处女作《月亮是太阳的梦想》上映，这是一部小成本的B级电影，描写了社会底层人的生存状态，后来他开始为杂志和报纸写影评，主持电视脱口秀节目，他的影评集《Video－drome:TheDiscreteCharmofWatchingFilms》成为了影迷的“电影观影圣经”。 1997年，执导公路喜剧片《三人组》。 1999年，执导微电影《审判》，收录在《世界名导短片集》中，讲述了在天灾人祸到来时，人们以利为先，信仰丧尸的黑色故事。 2000年，执导《共同警备区》，该部影片改编自朴相研的以南北分裂为题材的同名小说，在该片中他展示了不同寻常的思维模式，并且摆脱了一般韩国电影中的老套路，该影片获得了2000年韩国电影票房冠军，获选参赛第51届柏林电影节，并在日本创下100万人次的票房。 2002年，执导犯罪片《我要复仇》，以“无尽的绝望”和“真实的恐怖”而受到质疑。同年，加入了韩国民主工党，韩国最激进的左翼政党，与他同龄的电影导演奉俊浩也是这个党派的成员。 2004年，执导《老男孩》，吴大修自残一节受到《俄狄浦斯王》俄狄浦斯捅瞎自己双目的影响，朴赞郁本打算让吴大修在发现和女儿乱伦后切掉自己的命根，不过遭到崔岷植强烈抗议，最后只能以剪断舌头取代之，朴赞郁获得戛纳电影节评审团大奖。同年，与陈果、三池崇史执导《三更2》。 2005年，执导“复仇三部曲”的终结篇《亲切的金子》，在威尼斯电影节上获得小金狮奖和电影未来奖、最佳电影两个奖项。 2006年，执导爱情片《机器人之恋》，由Rain和林秀晶主演，获得第57届柏林国际电影节阿弗雷德堡尔奖。 2009年，与宋康昊合作吸血鬼题材恐怖片《蝙蝠》，获得戛纳电影节评委会大奖。 2011年，朴赞郁和弟弟朴赞卿共同用苹果iPhone手机拍摄电影《波澜万丈》，获得柏林电影节最佳短片金熊奖。 2013年，他的第九部电影也是首部英文电影《斯托克》在全球发行，影片云集了米娅·华希科沃斯卡、马修·古迪和妮可·基德曼等明星。同时，他为奉俊昊执导的电影《雪国列车》担任制片人。 2014年，朴赞郁与杰尼亚合作电影短片《孵花》，成为在时尚界的首秀。同年，与《老男孩》制作人任胜龙的YongFilm共同制作电影《小姐》，为电影《小姐》设立项目公司，该电影是根据英国同性恋女作家莎拉·沃特斯的第三部作品《指匠情挑》改编的作品，并入围2016年第69届戛纳国际电影节主竞赛单元金棕榈奖。 2016年，朴赞郁被颁发奥斯卡金像奖的美国电影艺术与科学学院(AMPAS)邀请担任奥斯卡评委会员，成为了美国电影艺术与科学学院的新会员。这是第二次有韩国电影人获邀为奥斯卡评委会员。 2020年10月，执导电影《分手的决心》，该片由汤唯、朴海日等主演。