1999年1月，林恩京在TTL（韩国移动通信品牌）的广告中以“神秘少女”形象出道。 2002年，林恩京与金贤成、安七炫、金星等领衔主演了由张善宇执导的科幻爱情电影《卖火柴的女孩再生》，自此开始了演艺事业。 2003年，与车承元、韩高恩等主演了爱情喜剧《保镖向前冲》，林恩京饰演单亲家庭长大的开朗少女“娜英”。 2004年8月6日，与金有美合作，主演了郑勇基执导的恐怖电影《人形师》，饰演主人公小时候丢弃的人偶（人形）“美娜”；8月13日，林恩京参演了由任昌丁、权伍中、边熙奉等主演的恐怖喜剧《时失2公里》；12月23日，与殷志源主演的喜剧电影《女高中生结婚记》上映，林恩京扮演了高中“打架王”安平江。 2005年，林恩京搭档姜恩菲、徐在敬、金起范等，主演了家庭情感喜剧《彩虹罗曼史》，其在剧中饰演了反应敏捷、喜好运动的行动派“金恩敬”。 2007年，与黄子华、李威和许绍雄等主演了由沈雷执导的都市情感剧《情爱保险》，林恩京出演外表漂亮能干，内心脆弱的“钻石玫瑰”童心愿。 2015年，林恩京在由申东烨执导，任昌丁、崔丹尼尔领衔主演的动作电影《治外法权》中，饰演了被无故卷入阴谋之中的平凡女孩“美善”。